Esta metodología está siendo incorporada al trabajo que desarrolla el Centro IRIS para el estudio de salmónidos en sistemas fluviales y lacustres del sur de Chile con el fin de detectar patógenos y conocer su circulación en ambientes naturales.
Investigadores del Centro IRIS participaron en un nuevo estudio publicado por Journal of Virological Methods orientado a mejorar la confiabilidad del diagnóstico molecular del virus de la necrosis pancreática infecciosa (IPNV), uno de los principales virus que afecta a los salmónidos.
En el marco del trabajo, liderado por la Dra. Yoanna Eissler (Universidad de Valparaíso) y con participación del Dr. Cristian B. Canales-Aguirre (Universidad de Los Lagos), ambos investigadores principales del Centro Nacional de Investigación en Ríos, Invasiones y Sistemas -IRIS-; además de Javiera García Véliz (Pontificia Universidad de Valparaíso), David Tapia (Universidad de Chile) y José Manuel Yáñez (Universidad de Chile), se validó una herramienta molecular que fortalece la vigilancia de este virus en salmónidos y aporta capacidades para estudiar la circulación de patógenos en ecosistemas acuáticos donde convergen especies introducidas, biodiversidad nativa y actividades humanas.
En la investigación publicada bajo el título “Diagnostic evaluation of an EF1α RT-qPCR assay for RNA quality control in IPNV detection”, se compararon diferentes métodos de RT-qPCR para medir el gen EF1α del pez, utilizado como control de calidad de las muestras. A partir de este análisis, los investigadores validaron un nuevo ensayo denominado ELF4, que permite verificar si el RNA extraído desde los tejidos se encuentra en condiciones adecuadas antes de interpretar el resultado de la detección viral, lo que es de gran importancia para establecer la calidad de las muestras y por ende la confiabilidad en el resultado.
Con respecto a la importancia de esta investigación y la utilización de esta metodología por parte del Centro IRIS, Yoanna Eissler señaló que “los salmónidos no sólo se encuentran circunscritos a los centros de cultivo, sino que también forman parte de ecosistemas fluviales y lacustres del sur de Chile, donde, como especies introducidas, interactúan con la biodiversidad nativa. Es por esto que contar con herramientas confiables para detectar virus asociados a salmónidos permite avanzar en una mirada más ecológica de la vigilancia sanitaria: no sólo saber si un virus está presente, sino generar información útil sobre su circulación en ambientes naturales”.
La metodología fue evaluada utilizando muestras de distintas especies de salmónidos y posteriormente validada con 500 muestras obtenidas durante un brote de necrosis pancreática infecciosa, mostrando un comportamiento estable y reproducible.
Esta herramienta puede contribuir a reducir la incertidumbre asociada a muestras de baja calidad y aumentar la confiabilidad de futuros estudios de vigilancia viral en ríos y lagos.
Actualmente, esta metodología está siendo incorporada al trabajo que desarrolla IRIS para el estudio de salmónidos en los ríos Petrohué y Riñinahue.
Revisa aquí la publicación científica con acceso abierto hasta el 12 de noviembre de 2026